Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Nccrp1G3X9C2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nccrp1G3X9C2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Nccrp1G3X9C2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms