Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igkv1-99F6XWB2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igkv1-99F6XWB2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igkv1-99F6XWB2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms