Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vmn1r238E9Q373 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Vmn1r238E9Q373 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Vmn1r238E9Q373 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vmn1r238E9Q373 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms