Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Upf2A2AT37 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Upf2A2AT37 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Upf2A2AT37 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Upf2A2AT37 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms