Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec2Q9WV35 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec2Q9WV35 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec2Q9WV35 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms