Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV5

Cacng3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng3Q9JJV5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cacng3Q9JJV5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cacng3Q9JJV5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cacng3Q9JJV5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacng3Q9JJV5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng3Q9JJV5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng3Q9JJV5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng3Q9JJV5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacng3Q9JJV5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacng3Q9JJV5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms