Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlirpQ9D8T7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlirpQ9D8T7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SlirpQ9D8T7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlirpQ9D8T7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlirpQ9D8T7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SlirpQ9D8T7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SlirpQ9D8T7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SlirpQ9D8T7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SlirpQ9D8T7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms