Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Tmem53Q9D0Z3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tmem53Q9D0Z3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem53Q9D0Z3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms