Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Trappc2Q9CQP2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Trappc2Q9CQP2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trappc2Q9CQP2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Trappc2Q9CQP2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms