Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim68Q8K243 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trim68Q8K243 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim68Q8K243 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim68Q8K243 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms