Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Snx16Q8C080 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx16Q8C080 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Snx16Q8C080 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Snx16Q8C080 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Snx16Q8C080 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Snx16Q8C080 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx16Q8C080 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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