Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pcdh8Q7TSK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pcdh8Q7TSK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pcdh8Q7TSK3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms