Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM3

Trim17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim17Q7TPM3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim17Q7TPM3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim17Q7TPM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim17Q7TPM3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim17Q7TPM3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms