Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Ncapd3Q6ZQK0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Ncapd3Q6ZQK0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ncapd3Q6ZQK0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ncapd3Q6ZQK0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms