Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg16l2Q6KAU8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atg16l2Q6KAU8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Atg16l2Q6KAU8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms