Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SkiQ60698 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SkiQ60698 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SkiQ60698 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SkiQ60698 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SkiQ60698 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SkiQ60698 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SkiQ60698 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SkiQ60698 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SkiQ60698 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SkiQ60698 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SkiQ60698 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SkiQ60698 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SkiQ60698 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms