Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3K5

Rabl6, Rab-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl6Q5U3K5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rabl6Q5U3K5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rabl6Q5U3K5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rabl6Q5U3K5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rabl6Q5U3K5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms