Protein–RNA interactions for Protein: Q571C7

Bdp1, Transcription factor TFIIIB component B'' homolog, mousemouse

Predictions only

Length 2,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bdp1Q571C7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bdp1Q571C7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bdp1Q571C7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bdp1Q571C7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bdp1Q571C7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bdp1Q571C7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bdp1Q571C7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bdp1Q571C7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bdp1Q571C7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms