Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0T4

Itgad, Integrin alpha-D, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgadQ3V0T4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgadQ3V0T4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ItgadQ3V0T4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ItgadQ3V0T4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ItgadQ3V0T4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ItgadQ3V0T4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms