Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lrrn4P59383 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lrrn4P59383 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lrrn4P59383 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms