Protein–RNA interactions for Protein: P46099

Klf1, Krueppel-like factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf1P46099 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Klf1P46099 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf1P46099 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf1P46099 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klf1P46099 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Klf1P46099 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf1P46099 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Klf1P46099 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Klf1P46099 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Klf1P46099 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Klf1P46099 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf1P46099 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Klf1P46099 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms