Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctnna1P26231 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctnna1P26231 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnna1P26231 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnna1P26231 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms