Protein–RNA interactions for Protein: P01736

T-cell receptor beta chain V region PHDS203 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01736 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01736 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01736 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01736 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01736 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01736 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P01736 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01736 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01736 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01736 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01736 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01736 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01736 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01736 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01736 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01736 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01736 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P01736 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01736 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01736 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01736 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01736 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01736 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01736 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01736 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01736 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01736 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01736 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01736 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01736 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01736 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01736 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01736 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01736 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01736 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01736 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01736 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01736 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01736 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms