Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem200cJ3QK46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem200cJ3QK46 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem200cJ3QK46 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.9 ms