Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtprsB0V2N1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtprsB0V2N1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtprsB0V2N1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PtprsB0V2N1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms