Protein–RNA interactions for Protein: A2ACJ2

Faap100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faap100A2ACJ2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Faap100A2ACJ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Faap100A2ACJ2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Faap100A2ACJ2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms