Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp5Q9Z2P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp5Q9Z2P8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms