Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LratQ9JI60 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LratQ9JI60 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LratQ9JI60 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LratQ9JI60 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms