Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD9

H2al1m, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1mQ9DAD9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1mQ9DAD9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1mQ9DAD9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1mQ9DAD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1mQ9DAD9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1mQ9DAD9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
H2al1mQ9DAD9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2al1mQ9DAD9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms