Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7X1

Kctd4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd4Q9D7X1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Kctd4Q9D7X1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Kctd4Q9D7X1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Kctd4Q9D7X1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Kctd4Q9D7X1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms