Protein–RNA interactions for Protein: Q9D534

Zc2hc1b, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc2hc1bQ9D534 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zc2hc1bQ9D534 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zc2hc1bQ9D534 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zc2hc1bQ9D534 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.7 ms