Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
4933428G20RikQ9D3X4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
4933428G20RikQ9D3X4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
4933428G20RikQ9D3X4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
4933428G20RikQ9D3X4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
4933428G20RikQ9D3X4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
4933428G20RikQ9D3X4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms