Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Srsf9Q9D0B0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Srsf9Q9D0B0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Srsf9Q9D0B0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms