Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
1700029P11RikQ9CQ68 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms