Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Smtnl1Q99LM3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smtnl1Q99LM3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smtnl1Q99LM3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms