Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdk5rap3Q99LM2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk5rap3Q99LM2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdk5rap3Q99LM2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdk5rap3Q99LM2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms