Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Synpo2Q91YE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Synpo2Q91YE8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Synpo2Q91YE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.1 ms