Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI51

Sorcs3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorcs3Q8VI51 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sorcs3Q8VI51 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sorcs3Q8VI51 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sorcs3Q8VI51 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sorcs3Q8VI51 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms