Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbm28Q8CGC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rbm28Q8CGC6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbm28Q8CGC6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
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