Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slc41a1Q8BJA2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slc41a1Q8BJA2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc41a1Q8BJA2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc41a1Q8BJA2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms