Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG19

Tmtc4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmtc4Q8BG19 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmtc4Q8BG19 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tmtc4Q8BG19 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tmtc4Q8BG19 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms