Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Nrde2Q80XC6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrde2Q80XC6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrde2Q80XC6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrde2Q80XC6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms