Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prpf38bQ80SY5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prpf38bQ80SY5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Prpf38bQ80SY5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prpf38bQ80SY5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms