Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Syne1Q6ZWR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Syne1Q6ZWR6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
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