Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GmipQ6PGG2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GmipQ6PGG2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GmipQ6PGG2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GmipQ6PGG2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms