Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wdr44Q6NVE8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wdr44Q6NVE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Wdr44Q6NVE8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wdr44Q6NVE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms