Protein–RNA interactions for Protein: Q5I043

Usp28, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp28Q5I043 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp28Q5I043 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Usp28Q5I043 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Usp28Q5I043 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Usp28Q5I043 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
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