Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Otol1Q4ZJM7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Otol1Q4ZJM7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Otol1Q4ZJM7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Otol1Q4ZJM7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms