Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

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Length 596 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Prdm6Q3UZD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Prdm6Q3UZD5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prdm6Q3UZD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms