Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Prr27Q3SYJ2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prr27Q3SYJ2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prr27Q3SYJ2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms